Advanced Next Generation Sequencing data analysis, 1.5 hp/credits
Denna kurs riktar sig till doktorander som arbetar med bioinformatisk analys av NGS-data. Kursen fokuserar på att utveckla praktiska färdigheter bortom kvalitetsbedömning av rådata, och därför krävs erfarenhet av att arbeta i linuxmiljö. NGS-applikationer som kan komma att vara en del av denna kurs är Targeted resequencing, RNA-seq, Chip-seq, Metagenomics and annotation. Undervisningen sker genom föreläsningar och datorövningar. Planerad kursvecka: 43 INFORMATION IN ENGLISH This course is aimed to PhD students who are directly performing bioinformatics analysis on NGS data. We will focus on developing practical skills beyond the quality assessment of raw data; therefore you need to have experience within the linux environment. NGS applications that may be part of this course include Targeted resequencing, RNA-seq, Chip-seq, Metagenomics and annotation. Teaching will be performed through lectures and computer exercises. Planned course week: 43 |
Kontaktperson: Arrangör: Medverkande: Allmän info om kurser vid SA / General information about courses at SA Kursplan Syllabus |